湖沼図は、日本の主要な湖沼とその沿岸を縮尺1万分1で表示した、わが国唯一の湖底地形図です。5ｍまたは1ｍごとの等深線で示した湖底地形、礫、砂、泥などの底質、水中植物などの自然的性質のほか、漁業、その他の関連施設を総合的に見ることができます。 平成21年3月までに、77湖沼・128面が刊行されています。図によっては測量年次の古いものもあります（昭和31年〜平成18年に作成）。
※詳しくは地図一覧図（主題図）をご覧下さい。